Mikrobiyoloji

BoFU-80: Ultrason destekli MALDI-TOF tanımlaması Rhizopus oryzae

Rhizopus oryzae toprakta, havada ve diğer maddelerde yaygın olarak bulunur. Gıda fermantasyonunda önemli bir küftür, çünkü gıdaların çürümesine neden olabilir. Kolonisi gevşek veya yoğundur, başlangıçta beyazdır ve daha sonra gri kahverengiden siyah kahverengiye döner. Sahte kökler iyi gelişmiştir, parmak veya kök benzeri dallanmalara sahiptir ve kırılması zor olan tipik filamentli mantarlardır. Protein, Bruker tarafından önerilen ve MALDI-TOF ile tanımlanan standart formik asit ekstraksiyon yöntemi kullanılarak ekstrakte edildi, ancak belirgin bir belirteç pik bulunamadı ve tespit edilemedi. Hücre duvarının kırılması ve ekstraksiyonu için bir reaktif kiti kullanıldıktan sonra, üç karakteristik tepe noktası tanımlandı, ancak çok fazla gürültü vardı ve tepe noktasının kütle oranı (m/z) 200'den azdı.

BoFU-80, akustik enerjiyi işlenecek numuneye konsantre etmek için yüksek frekanslı odaklanmış bir ultrason sistemi kullanır, bu da suşun protein ekstraksiyon oranını etkili bir şekilde artırabilir ve MALDI-TOF sisteminin algılama oranını artırabilir. MALDI-TOF tespiti için proteini çıkarmak için odaklanmış ultrason ve reaktif kiti kullanılarak, 400'den büyük bir tepe / kütle oranı (m / z) ve yüksek güvenilirliği gösteren 9.169 puan ile altı işaretleyici tepe noktası elde edildi.